molpit
Login:
Password:
remember
PIT00294 Физика эпигенетики

Рекомендую

Ruggero Cortini, Maria Barbi, Bertrand R. Caré, Christophe Lavelle, Annick Lesne, Julien Mozziconacci, and Jean-Marc Victor. The physics of epigenetics // Reviews of Modern Physics 88 (2), 025002 (2016). doi 10.1103/RevModPhys.88.025002, Prepint arXiv 1509.04145 (v1 2 Sep; v2 15 Dec 2015; 9 May 2016). http://arxiv.org/abs/1509.04145, 19/4/2020 Cited by 69

Захватывает дух! Но ... для меня это ещё один сигнал, что Принципы биологии клетки ab initio (PIT00174, PIT00220) продолжают развиваться, стремясь к формулировке точных законов фундаментальной биологии ... Основы теории биологических мер.

Образ, как и прообраз биологической переменной требует некоторого описания биологического образа аналогичного художественному образу. Аксиоматики био не существует, о чем сказал ещё Гёдель!

Ю.М. Лотман ввёл понятие семиосферы по аналогии с биосферой В.И. Вернадского. М. Барбьери создал биосемиотику и с помощью введенных им химических и биологических кодов наравне с культурными кодами PIT00482 сильно продвинулся в понимании биологического смысла аргументов, переменных и значений функций живой природы. Хочу обратить внимание на биосферу как на пространство биологических переменных, функций и значений функций многих биологических переменных. Подчеркиваю, без шуток, что именно это биопространство является правильным образом существования Живой Природы, которая создала и включила в себя живую почву. Конечно же надо согласиться с Владимиром Ивановичем, что ноосфера является пространством существования живого духа. Представление образных значений многих переменных часто разумно представлять в тесном слиянии с количественными характеристиками живых сущностей.

Совокупность образных и количественных значений любой биологической переменной без исключений является условной, т.е. переменной, значения которой зависят от состояния всех нижних и верхних уровней. Паттерны изменяются при переходе с уровня на уровень.

Создается БиоТеория. Многое прояснилось, пишется работа: «Переменные значения аргументов и функций в логике био». Многомерные пространства значений этих переменных сочетают образные и количественные условные величины. Биоматематика и биологика этих переменных создается для того, чтобы можно было строить точные суждения с биологическими паттернами на различных уровнях. Правила отображения с уровня на уровень надо изучать и раскрывать, т.к. живые объекты содержат программы с созидающими кодами PIT00482, причём биологические механизмы, работающие в рамках первых принципов, достаточно интересные.

Многое удаётся понять по результатам организации жизни в переменных, отношениях, событиях, статистиках, условных и совместных мерах, континуумах беспокойных состояний. Самое главное - это выживание созданных вновь артефактов, которое определяется расширениями химических и биологических кодов. Паттерн как волновая функция всей клетки и достаточно изолированных её частей. Передача паттерна преобразованием МакКлинток – органа в геном и обратно - основа теории биологических событий, с помощью которой рассматриваются самые главные состояния, преобразования их, измерение свойств с точки зрения биологического действия.

Понятие эквивалентности неприменимо для разных типов переменных. Так любые количественные значения невозможно сопоставить с образными значениями картин, стихов, музыки, танцев и, вообще, любой экспрессии. Тип отображения «экспрессия» требует тщательного рассмотрения. Кроме эквивалентности условность переменных высокой размерности потребуется особые усилий для согласования неколичественных характеристик роста и развития ...

Обновление 19/4/2020

«Физическая структура и структура данных трехмерного генома»

Kai Huang, Yue Li, Anne R. Shim, Ranya KA Virk, Vasundhara Agrawal, Adam Eshein, Rikkert J. Nap, Luay M. Almassalha, Vadim Backman, and Igal Szleifer. Physical and data structure of 3D genome // Science Advances 6 (2), eaay4055 (2020). doi 10.1126/sciadv.aay4055.

«ChIPSummitDB: база данных сайтов связывания транскрипционных факторов на основе ChIP-seq и топологическое расположение белков, связанных с ними»

Erik Czipa, Mátyás Schiller, Tibor Nagy, Levente Kontra, László Steiner, Júlia Koller, Orsolya Pálné-Szén, and Endre Barta. ChIPSummitDB: A ChIP-seq-based database of human transcription factor binding sites and the topological arrangements of the proteins bound to them // Database 2020, baz141 (2020). doi 10.1093/database/baz141

«Структура хроматина изменяется во время различных процессов с точки зрения последовательности ДНК»

Hui Quan, Ying Yang, Sirui Liu, Hao Tian, Yue Xue, and Yi Qin Gao. Chromatin structure changes during various processes from a DNA sequence view // Current opinion in structural biology 62, 1-8 (2020). doi 10.1016/j.sbi.2019.10.010

«Различение клеточного фенотипа с использованием клеточного эпигенотипа»

Thomas P. Wytock, and Adilson E. Motter. Distinguishing cell phenotype using cell epigenotype // Science Advances 6 (12), eaax7798 (2020). doi 10.1126/sciadv.aax7798

«Количественная оценка эпигенетической стабильности с минимальными путями действия»

Amogh Sood, and Bin Zhang. Quantifying Epigenetic Stability with Minimum Action Paths // Preprint bioRxiv 20 Feb (2020). doi 10.1101/2020.02.25.964726

Peter Belobrov 09 Jul 2016 05:50
© International Open Laboratory for Advanced Science and Technology — MOLPIT, 2009–2021