AAR в канале семинаров высказал интересные мысли. Как описывать поведение (алгоритмы) без использования языка программирования? Хороший перевод доклада Лесли Лэмпорта позволил «созидающие коды» высветить ещё ярче так. Существует принципиальная разница в описании поведения «до того» и «после того». Анекдотический ответ «вместо того» создаёт правило точнейшего понимания тонкостей отличия алгоритма от описания творческого или созидательного поведения. Предполагаю, что именно здесь DIA найдёт подсказку для «созидающих кодов».

По поводу вычислений на квантовом компьютере Google осталась информация здесь: [Arute2019], здесь: О «квантовом превосходстве» и здесь: Квантовое превосходство наступает, но это не изменит мир. Думаю, что наш подход к биологическим измерениям качественных свойств живых систем правильный и может быть предварительно определён как превосходство аналоговых вычислений над квантовыми, если не беспокоиться «совершенно дурацким» шифрованием, понимая, что биологическая эволюция в собственных «созидающих кодах» шифрование не применяет. Однако химические [Barbieri2003] и биологические [Barbieri2015] коды используются для перезаписывания генома при каждом клеточном делении [Shapiro2013].

Ссылки

{Arute2019} F. Arute, K. Arya, R. Babbush et al. Quantum supremacy using a programmable superconducting processor // Nature 574, 505–510 (2019). doi 10.1038/s41586-019-1666-5.

{Barbieri2003} Barbieri M. The organic codes. An introduction to semantic biology. Cambridge, UK: Cambridge University Press. 2003. 317 p.

{Barbieri2015} Marcello Barbieri. Code Biology: A New Science of Life. Springer International Publishing, 2015. 236 p.

{Shapiro2013} James A. Shapiro. How life changes itself: The Read–Write (RW) genome // Physics of Life Reviews, 10 (3), 287–323 (2013). doi 10.1016/j.plrev.2013.07.001 PDF uchicago.edu

Вчерашняя дискуссия на семинаре и статьи [Lehallier2019, Williams2019] позволили предложить точное новое понятие «аптамерный биологический анализ», который позволяет говорить о новом направлении в биологической и медицинской метрологии. Кроме уже хорошо разработанных биологических мер для измерения качественных переменных с помощью аптамеров, новое понятие «liquid health check» = «проверка здоровья жидкостью» конечно же является примером биологической меры и сразу же предлагает нам «microfluidic chip health check (MCHC)» = «оценка состояния здоровья микрофлюидным чипом».

Правда, замечу, что сокращение MCHC занято в эритроцитарных индексах для средней концентрации гемоглобина в эритроцитах (MCHC). У нас же есть супер-сокращение «сторожки», так что прорвёмся.

О введенные нами недавно с помощью сторожков биологических мерах мы уже начали рассказывать в статьях [Denisov2018, Lukyanenko2019, Belobrov2019, Yakimov2019] и подробнее расскажем в готовящихся для защиты кандидатских диссертациях.

Презентация доклада PIT Biological Measures (pdf, 1522КБ) на IMEKO-2019 Symposium 2/7/2019 и первая публичная лекция по биологическим мерам 25/9/2019 в Нижнем Новгороде К новым биомерам (pdf, 1519КБ) на Biological Measures на этом сайте выложены. Они являются введением в проблему биологических мер. Конечно, уже пора готовить полный обзор по биологической метрологии с нашим подходом.

Ссылки

{Lehallier2019} Benoit Lehallier at al. Undulating changes in human plasma proteome profiles across the lifespan // Nature Medicine 25 (12), 1843–1850 (2019). doi 10.1038/s41591-019-0673-2 (Аптамерный протеомный анализ плазмы у здоровых людей в возрасте 18–95 лет выявляет волнообразные паттерны экспрессии белка, связанные с возрастными заболеваниями и фенотипическими признаками.)

{Williams2019} Stephen A. Williams et al. Plasma protein patterns as comprehensive indicators of health // Nature Medicine 25 (12), 1851–1857 (2019). doi 10.1038/s41591-019-0665-2 (Крупномасштабное аптамерное сканирование белков плазмы в сочетании с машинным обучением демонстрирует подтверждение концепции и осуществимость индивидуальной проверки здоровья с использованием одного образца крови. В этой статье впервые было введено новое понятие «liquid health check»).

{Denisov2018} Denisov I.A., Lukyanenko K.A., Yakimov A.S., Kukhtevich I.V., Esimbekova E.N., Belobrov P.I. Disposable luciferase-based microfluidic chip for rapid assay of water pollution // Luminescence. 2018. Vol. 33(6), P. 1054–1061. DOI: 10.1002/bio.3508

{Lukyanenko2019} Lukyanenko, K. A., Denisov, I. A., Sorokin, V. V., Yakimov, A. S., Esimbekova, E. N., & Belobrov, P. I. Handheld Enzymatic Luminescent Biosensor for Rapid Detection of Heavy Metals in Water Samples // Chemosensors, 7 (1), 16 (2019). DOI: 10.3390/chemosensors7010016

{Belobrov2019} P I Belobrov, A A Evstrapov, E N Esimbekova, I A Denisov, K A Lukyanenko, E D Osipova and A S Yakimov. Towards biological quantity theory for nominal property metrology in polyenzymatic devices with living cells // J. Phys.: Conf. Ser. 1379, 012036 (2019). DOI: 10.1088/1742-6596/1379/1/012036

{Yakimov2019} Yakimov A.S., Osipova E.D., Morgun A.V., Boytsova E.B., Belobrov P.I., Salmin V.V., Salmina A.B. Measuring microfluidic system for the mammalian brain cells cultivation // "Nauchnoe Priborostroenie" 29 (4), 51-56 (2019). DOI: 10.18358/np-29-4-18117b

и более ранние наши статьи на этом сайте Публикации.

Сегодня соберёмся вместе, тихо посидим, вспоминая дела Пола Аллена, ушедшего от нас год назад, которые всегда будут помогать нам разбираться с родословной клеточной книги.

Сегодня перечитаем в прекрасном переводе Алексея Андреева книгу:
Пол Аллен.
Миллиардер из Кремниевой долины.
История соучредителя Microsoft. 2012.

и на сайте About Paul Allen
о том, что сделал Пол Аллен в жизни.

Пол Аллен и его институты (pdf, 472КБ)

Подробнее см.: Институты, созданные Полом Алленом.

The Royal Swedish Academy of Sciences has decided to award the 2019 Nobel Prize in Chemistry to John B. Goodenough, The University of Texas at Austin, USA, M. Stanley Whittingham, Binghamton University, State University of New York, USA, and Akira Yoshino, Asahi Kasei Corporation, Tokyo, Japan, Meijo University, Nagoya, Japan ”for the development of lithium-ion batteries”.

Королевская Шведская Академия Наук решила присудить Нобелевскую премию по химии 2019 года Джону Гудену, Университет Техаса в Остине, США, Стэнли Уиттингему, Университет Бингемтона, Государственный университет Нью-Йорка, США, и Акире Йошино, Корпорация Асахи Касей, Токио, Япония, Мейхо Университет, Нагоя, Япония «за разработку литий-ионных батарей».

Popular information.

Press release: The Nobel Prize in Chemistry 2019.

Advanced information.

The Royal Swedish Academy of Sciences has decided to award the Nobel Prize in Physics 2019 “for contributions to our understanding of the evolution of the universe and Earth’s place in the cosmos” with one half to James Peebles, Princeton University, USA “for theoretical discoveries in physical cosmology” and the other half jointly to Michel Mayor, University of Geneva, Switzerland and Didier Queloz, University of Geneva, Switzerland University of Cambridge, UK “for the discovery of an exoplanet orbiting a solar-type star”.

Королевская Шведская Академия Наук решила присудить Нобелевскую премию по физике 2019 года «за вклад в наше понимание эволюции Вселенной и места Земли в космосе», одну половину - Джеймсу Пиблсу, Принстонский университет, США, «за теоретические открытия в области физической космологии», а другую половину совместно Мишелю Майору, Университет Женевы, Швейцария, и Дидье Келосу, Университет Женевы, Швейцария, Университет Кембриджа, Великобритания, «за открытие экзопланеты, вращающейся вокруг звезды солнечного типа».

Popular information.

Press release: The Nobel Prize in Physics 2019.

Advanced information.

Подробнее на русском читайте в тексте Анатолия Глянцева: Нобелевскую премию по физике вручили за изучение прошлого Вселенной и открытие уникальной экзопланеты 08.10.2019 13:20M.