Это пост посвящен Дэвиду Гудселлу (David Goodsell).

8:45-9:05am - David Goodsell, Scripps Research. 2022 Seattle Cell Science Symposium - Day 2, 21.08-43.02 “Building Structural Models of a Whole Bacterial Cell” = «Построение структурных моделей целой бактериальной клетки».

Аннотация: Основываясь на предыдущих художественных подходах к визуализации молекулярной структуры живых клеток, мы создали 3D-модели целой бактериальной клетки, включающей все макромолекулы. Концентрация, положения и взаимодействия молекул взяты из последних компьютерных моделей биологии целых клеточных систем, интегрированы с экспериментальными и смоделированными по гомологии структурами 482 белковых мономеров и 201 белковых комплексов, а также основанными на решетке моделями генома, РНК и связанных с ними структур. макромолекулы. Был разработан вычислительный рабочий процесс для упрощения сбора и курирования этих структур, определения «рецепта», определяющего состав клеточной модели, а также построения и оптимизации моделей на основе этого рецепта. Также были разработаны методы визуализации, позволяющие исследовать функциональные характеристики генома и протеома.

См. сайт Гудселла: Welcome to my new website!) To reflect the expanding interests of our labs, Art Olson, Stefano Forli, Michel Sanner and I have recently rebranded the Molecular Graphics Laboratory as the Center for Computational Structural Biology (CCSB).

Основные книги Гудселла:

David S. Goodsell. Bionanotechnology: Lessons from Nature. Wiley-Liss, 2004. 347 p.

David S. Goodsell. The Machinery of Life. 2nd Ed. Copernicus Books, 2009. 170 p.

David S. Goodsell. Atomic Evidence: Seeing the Molecular Basis of Life. Copernicus, Year: 2016. 180 p.