molpit
Login:
Password:
remember

Изучение роли экстракодирующих РНК (ecRNAs) активно продолжается в интересных новых работах, которые буду реферировать здесь. Сначала обновлю пост PIT00306.

{Savell2016} Katherine E. Savell, Nancy VN Gallus, Rhiana C. Simon, Jordan A. Brown, Jasmin S. Revanna, Mary Katherine Osborn, Esther Y. Song et al. Extra-coding RNAs regulate neuronal DNA methylation dynamics // Nature Communications 7, 12091 (2016). doi 10.1038/ncomms12091

Peter Belobrov 09 Feb 2017 12:00

3 года назад https://ru.wikipedia.org/wiki/Метилирование_ДНК экстракодирующие РНК (extra-coding RNAs или ecRNAs) были открыты в работе [Ruscio2013]. Важность этого открытия была подчеркнута в прекрасном обзоре [Cech2014].

Название ecRNAs было предложено в патенте с приоритетом 2012 Annalisa Di Ruscio, Alexander K. Ebralidze, Daniel G. Tenen, and Giuseppe Leone. "Chimeric rna oligonucleotides and uses thereof." U.S. Patent Application 14/111,971, filed April 13, 2012. (опубликован в 2014), но приживалось медленно (всего 9 раз "extra-coding RNA" нашел Google).

Прочтите популярное объяснение важной роли ecRNAs в регулировании взаимодействия РНК с метилтрансферазами в кратком реферате [Chi2016b], полной статье [Chi2016] и на русском (ссылка в начале поста). Статьи [Chi2016] начинается так. Пятнадцать лет назад реализован первый проект секвенирования человеческого генома. В то время предсказывали, что люди имели между 25000 и 40000 генов, которые кодируют белки. Эта оценка продолжает падать. У человека на самом деле, кажется, всего лишь 19 000 таких генов - всего лишь 1-2 % генома. Ключ к нашей сложность заключается в том, как эти гены регулируются остальные 99 % нашей ДНК, известной как "темная материя" генома. Рисунок из краткого реферата [Chi2016b] помогает понять суть

jeremy_day_graphic (31Кб)
[Chi2016b]

{Ruscio2013} Annalisa Di Ruscio et al. DNMT1-interacting RNAs block gene-specific DNA methylation // Nature 503 (7476), 371-376 (2013). doi 10.1038/nature12598 Cited by 196 & 67 in 2016 & 4 in 2017 (9/2/2017).

{Cech2014} Thomas R. Cech, Joan A. Steitz. The noncoding RNA revolution—trashing old rules to forge new ones // Cell 157 (1), 77-94 (2014). doi 10.1016/j.cell.2014.03.008 (cited by 405)

{Chi2016b} Kelly Rae Chi. Non-coding RNA Controls the Epigenetics of Memory ecRNAs (pdf, 252КБ) // BioTechniques 11/8/2016

{Chi2016b} Kelly Rae Chiю The dark side of the human genome // Nature 538 (7624), 275-277 (2016). doi 10.1038/538275a

Peter Belobrov 12 Aug 2016 11:34
© International Open Laboratory for Advanced Science and Technology — MOLPIT, 2009–2021