Обсудим перепрограммирование (репрограммирование) клеток. Жаль, эта статья уже 2 года не редактировалась! В английской статье Wiki в Reprogramming вложен эпигенетический смысл. Надо заметить, что в понятие "перепрограммирование клеток" давно уже вкладывается таинственный смысл и запутанное содержание, которое время от времени принципиально изменяется. Надо будет разбираться серьёзно.

Вспомним мудрую мысль Дениса Нобла: "Никаких генетических программ не существует" (см PIT00318 "Программы без алгоритмов)".

Эпигенетическое перепрограммирование (docx, 2586КБ) начнём с внимательного прочтения этого перевода с точным анализом логики смысла биологических программ (перевод Reprogramming).

Обратите внимание на моё замечание: «В истории овечки Долли есть много тёмных мест, которые связаны с до сих пор не выясненным смыслом биологического программирования и соответственно перепрограммирования клеток».

Чтобы понимать правильно смысл биологического действия везикул в живых организмах ниже приведен рисунок статьи [1] из книги [2].

Биогенез различных внеклеточных везикул и внеклеточных везикулоподобных наночастиц.
(A) Экзомеры представляют собой внеклеточные везикулоподобные немембранные наночастицы. Конкретные процессы, участвующие в биогенезе экзомер, в настоящее время неизвестны.
(B) Биогенез экзосом включает эндоцитоз и последующее слияние эндоцитарных везикул с ранними эндосомами. Во время созревания ранней эндосомы в мультивезикулярное тело, внутрипросветные везикулы образуются через внутреннее почкование эндосомальной мембраны. Внутрипросветные везикулы могут либо разрушаться при слиянии мультивезикулярных телец с лизосомами, либо секретироваться во внеклеточный матрикс посредством слияния мультивезикулярных телец с плазматической мембраной. После высвобождения внутрипросветные везикулы называются экзосомами.
(C) Эктосомы или сбрасываемые микровезикулы непосредственно попадают во внеклеточный матрикс через наружное почкование плазматической мембраны.
(D) Миграсомы образуются на концах или пересечениях ретракционных волокон во время миграции клеток и секретируются во внеклеточный матрикс после отделения от ретракционных волокон.
(E) Апоптотические тельца непосредственно секретируются во внеклеточный матрикс из мембранных выступов/пузырей, которые возникают в апоптотических клетках.
(F) Большие онкосомы обычно высвобождаются из мембранных пузырей амебоидных опухолевых клеток и были идентифицированы для инкапсулирования онкогенного груза. EVs внеклеточные везикулы; ЕСМ внеклеточный матрикс; MVB многовезикулярное тело.

1. {Kang2021} Kang, Taeyoung, Ishara Atukorala, and Suresh Mathivanan. Biogenesis of extracellular vesicles (Биогенез внеклеточных везикул) // New Frontiers: Extracellular Vesicles (2021): 19-43. doi 10.1007/978-3-030-67171-6_2

2. {Mathivanan2021} Suresh Mathivanan, Pamali Fonseka, Christina Nedeva, Ishara Atukorala. New Frontiers: Extracellular Vesicles (Новые рубежи: внеклеточные везикулы). Springer, 2021. 539 p. doi 10.1007/978-3-030-67171-6

Если везикулам приписывать способности генетических программистов PIT00590, то почему бы не приписать им талант биологических инженеров [1]. Правда несмотря на авторитетное издание, эту идею пока никто не поддержал.

1. {Zanellati2022} Zanellati, Maria Clara, and Sarah Cohen. The endosome as engineer (Эндосома как инженер) // Science 378 (6625), 1173-1174 (2022). doi 10.1126/science.adf5112

Вопрос о биологическом программировании до сих пор открыт. Поэтому работа [1] сразу привлекла внимание.

1. {Raposo2024} Raposo, Graça, and Philip D. Stahl. Extracellular vesicles, genetic programmers (Внеклеточные везикулы, генетические программисты) // Nature Cell Biology 26 (1), 22-23 (2024). doi 10.1038/s41556-023-01277-8

7 лет назад была предложена идея нового языка клеточной коммуникации на раннем этапе эмбрионального развития внеклеточными везикулами [1]. Мысль о связи клеток с помощью внеклеточных везикул достаточно давняя [2], хотя только в последнее время стала интенсивно привлекать исследователей. В работе [3] предложена идея нового биологического языка на основе внеклеточных везикул.

1. {Cruz2018} Cruz, Lilian, Jenny AA Romero, Rebeca P. Iglesia, and Marilene H. Lopes. Extracellular vesicles: decoding a new language for cellular communication in early embryonic development (Внеклеточные везикулы: расшифровка нового языка клеточной коммуникации на раннем этапе эмбрионального развития) // Frontiers in cell and developmental biology 6, 94 (2018). doi 10.3389/fcell.2018.00094 (24/3/2024) Cited by 48

2. {Tkach2016} Tkach, Mercedes, and Clotilde Théry. Communication by extracellular vesicles: where we are and where we need to go (Коммуникация посредством внеклеточных везикул: где мы находимся и куда нам нужно идти) // Cell 164 (6), 1226-1232 (2016). doi 10.1016/j.cell.2016.01.043 (24/3/2024) Cited by 3008

3. {Raposo2023} Raposo, Graca, and Philip D. Stahl. Extracellular vesicles - on the cusp of a new language in the biological sciences (Внеклеточные везикулы – на пороге нового языка биологических наук) // Extracell Vesicles and Circulating Nucleic Acids 4 (2), 240-254 (2023). doi 10.20517/evcna.2023.18